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Title: Prospección de virus y viroides que infectan cacao (Theobroma cacao L.) y café (Coffea arabica L.) en el departamento de Amazonas, Perú
Advisor(s): Fiore, Nicola; Zamorano, Alan
OCDE field: https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.00
Issue Date: 2023
Institution: Universidad de Chile
Abstract: El cacao y el café son cultivos importantes para el Perú como centro de origen del cacao y producción orgánica del café. Sin embargo, a pesar de su importancia económica, no existe información acerca de los virus y viroides que podrían estar infectando en estos cultivos en el Perú. En este trabajo, se propuso obtener el viroma asociado a estas especies, mediante Next-Generation Sequencing NGS. Primero se realizó una prospección en el banco germoplasma de cacao de la Universidad Toribio Rodríguez de Mendoza en Chachapoyas y en zonas cafetaleras del departamento de Amazonas, se colectaron 10 muestras de café y 11 de cacao, las cuales tenían síntomas asociables con virus y/o viroides. Se extrajo el ARN total para realizar NGS. Las secuencias crudas se ensamblaron utilizando CLC Genomics, y los contigs resultantes mediante BLASTx, presentaron identidad nucleotídica similar a 3 géneros virales en muestras de cacao y solo pequeños fragmentos de potencial origen viral en café. Los géneros virales identificados fueron un Emaravirus, un Badnavirus y un Petuvirus para cacao y rastros de Begomovirus y Petuvirus para café. Finalmente, se realizó la validación en campo de los virus detectados en cacao, mediante análisis RT-PCR utilizando partidores específicos de los virus diseñados a partir de secuencias genómicas obtenidas. Este trabajo representa la primera detección de virus en cacao en el Perú.
Note: Acceso restringido. Si desea contactar al autor, escriba a renati@sunedu.gob.pe para reenviar su consulta.
Discipline: Ciencias Agropecuarias
Grade or title grantor: Universidad de Chile. Facultad de Ciencias Agronómicas
Grade or title: Magíster en Ciencias Agropecuarias
Register date: 28-Sep-2023

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