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Fiore, Nicola
Zamorano, Alan
Huaman Pilco, Angel Fernando
2023-09-28T20:57:10Z
2023-09-28T20:57:10Z
2023
https://renati.sunedu.gob.pe/handle/sunedu/3455048
Acceso restringido. Si desea contactar al autor, escriba a renati@sunedu.gob.pe para reenviar su consulta. (es_PE)
El cacao y el café son cultivos importantes para el Perú como centro de origen del cacao y producción orgánica del café. Sin embargo, a pesar de su importancia económica, no existe información acerca de los virus y viroides que podrían estar infectando en estos cultivos en el Perú. En este trabajo, se propuso obtener el viroma asociado a estas especies, mediante Next-Generation Sequencing NGS. Primero se realizó una prospección en el banco germoplasma de cacao de la Universidad Toribio Rodríguez de Mendoza en Chachapoyas y en zonas cafetaleras del departamento de Amazonas, se colectaron 10 muestras de café y 11 de cacao, las cuales tenían síntomas asociables con virus y/o viroides. Se extrajo el ARN total para realizar NGS. Las secuencias crudas se ensamblaron utilizando CLC Genomics, y los contigs resultantes mediante BLASTx, presentaron identidad nucleotídica similar a 3 géneros virales en muestras de cacao y solo pequeños fragmentos de potencial origen viral en café. Los géneros virales identificados fueron un Emaravirus, un Badnavirus y un Petuvirus para cacao y rastros de Begomovirus y Petuvirus para café. Finalmente, se realizó la validación en campo de los virus detectados en cacao, mediante análisis RT-PCR utilizando partidores específicos de los virus diseñados a partir de secuencias genómicas obtenidas. Este trabajo representa la primera detección de virus en cacao en el Perú. (es_PE)
Perú. Programa Nacional de Becas y Crédito Educativo (Pronabec). Beca Generación Bicentenario (es_PE)
Tesis (es_PE)
application/pdf (es_PE)
spa (es_PE)
Universidad de Chile (es_PE)
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess (es_PE)
Superintendencia Nacional de Educación Superior Universitaria - SUNEDU (es_PE)
Registro Nacional de Trabajos de Investigación - RENATI (es_PE)
Café (es_PE)
Café (Coffea arabica) (es_PE)
Cacao (Theobroma cacao) (es_PE)
Emaravirus (es_PE)
Badnavirus (es_PE)
Petuvirus (es_PE)
Secuenciación de nucleótidos de alto rendimiento (es_PE)
Prospección de virus y viroides que infectan cacao (Theobroma cacao L.) y café (Coffea arabica L.) en el departamento de Amazonas, Perú (es_PE)
info:eu-repo/semantics/masterThesis (es_PE)
Universidad de Chile. Facultad de Ciencias Agronómicas (es_PE)
Ciencias Agropecuarias (es_PE)
Magíster en Ciencias Agropecuarias (es_PE)
CL (es_PE)
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.00 (es_PE)
http://purl.org/pe-repo/renati/level#maestro (es_PE)
https://orcid.org/0000-0001-6494-2257 (es_PE)
https://orcid.org/0000-0003-2770-991X (es_PE)
48157436
http://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis (es_PE)

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