Genotipificación del virus respiratorio sincitial tipo A en muestras nasofaríngeas en pacientes pediátricos hospitalizados con diagnóstico clínico de Infección Respiratoria Aguda (IRA) procedentes de Lima y Cajamarca, durante el periodo 2009 - 2020

Abstract

Objetivo: Genotipificar el Virus Respiratorio Sincitial (VRS) tipo A en muestras nasofaríngeas de pacientes pediátricos hospitalizados con el diagnóstico clínico de infección respiratoria aguda en hospitales nacionales de Perú.

Métodos: Se realizó un análisis de datos secundarios a partir de un estudio transversal previo realizado en niños con Infección Respiratoria Aguda del 2009 al 2012 y del 2018-2020. Todas las muestras han sido analizadas mediante la Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) para VRS-A, luego fueron secuenciadas, alineadas y finalmente se determinó el genotipo de cada una.

Resultados: Se estudiaron un total de 211 muestras positivas para VRS-A de las cuales 93 muestras fueron positivas al secuenciamiento y el genotipo más frecuente encontrado mediante estudio filogenético fue el ON1, con 86.79% de los casos y el NA1 con 13.21% de los casos.

Conclusiones: Hubo una alta prevalencia de VRS-A del genotipo ON1 en la población estudiada. Los casos de VRS-A, en Perú, fueron más prevalentes en los meses de marzo a junio.

Objective: To genotype RSV type A in nasopharyngeal samples from pediatric hospitalized patients with the clinical diagnosis of acute respiratory infection in national hospitals in Peru.

Methods: A secondary data analysis was carried out from a previous cross-sectional study performed in children with Acute Respiratory Infections from 2009 to 2012 and from 2018 to 2020. All samples have been analyzed through the Polymerase Chain Reaction (PCR) for RSV-A, subsequently they were sequenced, aligned and finally the genotype of each one was determined.

Results: A total of 211 RSV-A positive samples were studied, of which 93 samples were positive to sequencing and the most frequent genotype found by phylogenetic study was ON1, with 86.79% of cases and NA1 with 13.21%. of the cases.

Conclusions: There was a high prevalence of RSV-A of the ON1 genotype in the studied environment. RSV-A cases, in Peru, prevalence was higher in the months of march and june.