Identificación molecular de bacterias con potencial capacidad promotora de crecimiento vegetal aisladas de la rizósfera de Capsicum annuum cv. Piquillo

Abstract

La agricultura es una de las principales actividades económicas de la sociedad humana, sin embargo, la producción y rendimiento agrícola se ve disminuida por diversos tipos de estrés. Frente a este problema, se está utilizando microrganismos promotores de crecimiento vegetal como alternativa biotecnológica con impacto medioambiental mínimo. Se identificó aislados bacterianos de la rizósfera del cultivo de Capsicum annuum cv. Piquillo mediante análisis genómico dirigido al gen ADNr 16s. Dichas bacterias fueron aisladas mediante diluciones seriadas y cultivo en medio sólido en placas a partir de muestras de suelo rizosférico. Luego, se realizó la extracción de ADN genómico a partir de cultivos puros de los aislados, secuenciamiento y análisis bioinformático. Finalmente, se determinó aquellos aislados con potencial capacidad promotora de crecimiento vegetal en base a referencias bibliográficas correspondientes a cada género o especie identificada. Se determinó siete aislados a nivel de género: Ca2 y Ca5 corresponden a Staphylococcus sp.; mientras que, Ca3, Ca4, Ca8, Ca10 y Ca11 corresponden a Bacillus sp. Además, se identificó cinco aislados a nivel de especie: Ca1 corresponde a Streptomyces roseolilacinus, Ca6 a Staphylococcus arlettae, Ca7 a Staphylococcus xylosus, Ca9 a Bacillus firmus y Ca12 a Bacillus humi. Se concluye que de los doce aislados identificados, siete correspondientes al género Bacillus y uno a la especie Streptomyces roseolilacinus presentan potencial capacidad promotora de crecimiento vegetal.

Agriculture is one of the major economic activities of human society, however, agricultural production and yield is diminished by various types of stress. To face this problem, plant growth-promoting microorganisms are being used as a biotechnological alternative with minimal environmental impact. Bacterial isolates from the rhizosphere of Capsicum annuum cv. Piquillo were identified by genomic analysis targeted to the 16s rDNA gene. Bacteria were isolated from rhizospheric soil samples by serial dilutions and cultured in solid medium agar plates. Then, genomic DNA extraction from pure cultures of each isolate, sequencing and bioinformatic analysis were performed. Finally, isolates with potential plant growth-promoting capacity were determined based on bibliographic references corresponding to each identified genus or species. Seven isolates were determined at a genus level: Ca2 and Ca5 match to Staphylococcus sp.; while, Ca3, Ca4, Ca8, Ca10 and Ca11 match to Bacillus sp. Besides, five isolates were identified at a species level: Ca1 matches to Streptomyces roseolilacinus, Ca6 to Staphylococcus arlettae, Ca7 to Staphylococcus xylosus, Ca9 to Bacillus firmus and Ca12 to Bacillus humi. It is concluded that from the twelve identified isolates, seven that that match to the genus Bacillus and one of the species Streptomyces roseolilacinus have potential plant growth-promoting capacity.