Diversidad bacteriana asociada al suelo del sotavento del piso superior del ACP Lomas del Cerro Campana mediante análisis metataxonómicos

Abstract

El desarrollo de nuevas estrategias para la conservación de la biodiversidad y la gestión sostenible requieren una comprensión completa del proceso abiótico del suelo. Sin embargo, los cambios estacionales causan estrés en el suelo, lo que afecta directamente la actividad del microbioma. El objetivo de esta tesis es determinar la diversidad bacteriana presente en el suelo del sotavento del piso superior del ACP Lomas del Cerro Campana en 2 épocas diferentes, empleándose metodologías moleculares actuales para obtener perfiles metataxonómicos. Se recolectaron tres muestras de suelo tanto para época húmeda (julio) y seca (diciembre), identificándose como flora acompañante a Solanum habrochaites S. Knapp & D.M. Spooner “tomate silvestre” y Tillandsia multiflora Benth. [=Racinaea multiflora (Benth.) M.A. Spencer & L.B. Sm.] “achupalla verde”. Así mismo, se analizaron diversos parámetros físicos-químicos del suelo siendo los más influyentes la conductividad eléctrica (época seca) y materia orgánica (época húmeda). Los resultados del análisis metataxonómicos del suelo contienen 41 clases, 110 familias y 140 géneros, las clases principales son Alphaproteobacteria (época húmeda) y Actinobacteria (época seca), mientras que Acidobacteriae, Bacteroidia, Cyanobacteria, Gammaproteobacteria, Vicinamibacteria, Thermoleophilia, Blastocatellia, Phycisphaerae y Verrucomicrobiae se encontraron en menor proporción en ambas épocas. En las familias principales está Xantobacteraceae, Sphingomonadaceae, Geodermatophilaceae, Micrococcaceae, Pseudonocardiaceae, Streptomycetaceae, Spirosomaceae, Nostocaceae, Phycisphaerae. Finalmente, entre los géneros predominantes se encuentra a Pseudolabrys, Microvirga, Ellin 6055, Afipia, Sphingomonas, Blastococcus, Streptomyces, WD2101 soil group, Nostoc PCC 73102, Dyadobacter. En conclusión, los parámetros físico-químicos, la flora aledaña a los puntos de muestreo y la estación en el Área de Conservación Privada Lomas del Cerro Campana, ejerce una fuerte influencia en la estructura de la comunidad bacteriana del suelo del sotavento del piso superior de dicho recinto. Por último, las comunidades microbianas presentes podrían ser de interés biotecnológico en diversas áreas como en la minería, medica, agroindustria, entre otros. Palabras claves: Metataxonómica; Comunidad bacteriana; ACP Lomas del Cerro Campana; Época seca; Época húmeda.