Caracterización Molecular de cepas resistentes a carbapenemas de Pseudomonas aeruginosa de pacientes infectados intrahospitalariamente de los Centros Hospitalarios de Ayacucho, enero-junio, 2022

Abstract

El aumento de resistencias bacterianas a los antimicrobianos representa un desafío en su manejo y un problema para la salud pública. Pseudomonas aeruginosa es uno de los patógenos oportunistas y nosocomiales de mayor relevancia clínica por resistencia a antibióticos betalactámicos como los carbapenémicos lo que dificulta su tratamiento. El objetivo del trabajo fue caracterizar molecularmente las cepas resistentes a carbapenemas de P. aeruginosa de pacientes infectados intrahospitalariamente de los Centros Hospitalarios de Ayacucho, enero-junio. 2022, enfocándonos en la detección y secuenciación de los genes blaIMP, blaVIM, blaNDM. Para alcanzar dicho objetivo se identificaron a las cepas de P. aeruginosa resistentes a carbapenemas usando 86 fichas de IAAS (infecciones asociadas a la atención de la salud), obteniéndose 11 casos de P. aeruginosa, de las cuales 5 presentaban resistencia a carbapenemas. Para la obtención del cultivo joven, se realizó la reactivación de las 5 cepas. Se realizaron las pruebas bioquímicas para su confirmar que las cepas eran P. aeruginosa. Las cepas reactivadas fueron secuenciadas a través de la tecnología Oxford Nanopore. Con análisis bioinformáticos se determinó la presencia de dos tipos del gen blaIMP, blaIMP-74 y blaIMP-16, pero sólo en algunas cepas. A nivel de laboratorio (wet lab) se validó (confirmó) la presencia de los genes estudiados con electroforesis. En conclusión, se determinó la presencia de los genes blaIMP-74 y blaIMP-16 sólo en las cepas de PsAs01 y PsAs05, y todas las cepas estudiadas no presentan los genes blaVIM y blaNDM. La detección de genes que generan resistencia a carbapenémicos nos permitiría ver opciones terapéuticas con mayor eficacia, así también tener información para predecir los brotes, y con ello poder formular estrategias más efectivas para el control y prevención de las infecciones causadas por P. aeruginosa

The increase in bacterial resistance to antimicrobials represents a challenge in its management and a problem for public health. Pseudomonas aeruginosa is one of the opportunistic and nosocomial pathogens of greatest clinical relevance due to resistance to beta-lactam antibiotics such as carbapenems, which makes its treatment difficult. The aim of this study was to molecularly characterize carbapenem-resistant strains of P. aeruginosa from hospital-infected patients at the Hospital Centers of Ayacucho, January-June 2022, focusing on the detection and sequencing of the blaIMP, blaVIM, blaNDM genes. To achieve this aim, resistant to carbapenems strains of P. aeruginosa were identified using 86 files of IAAS (infections associated with health care), obtaining 11 cases of P. aeruginosa, 5 of which presented resistance to carbapenems. To obtain the young culture, the reactivation of the 5 strains was carried out. Biochemical tests were performed to confirm that the strains were P. aeruginosa. The reactivated strains were sequenced using Oxford Nanopore technology. Through bioinformatics analysis, the presence of two types of the blaIMP gene, blaIMP-74 and blaIMP-16, was determined but only in some strains. At the laboratory level (wet lab), the presence of the genes studied was validated (confirmed) with electrophoresis. In conclusion, the presence of the blaIMP-74 and blaIMP-16 genes was determined only in the PsAs01 and PsAs05 strains, and all the strains studied do not present the blaVIM and blaNDM genes. The detection of genes that generate resistance to carbapenems would allow us to see therapeutic options with greater effectiveness, as well as have information to predict outbreaks, and thus be able to formulate more effective strategies for the control and prevention of infections caused by P. aeruginosa.