?Efecto de la uni?n de apt?meros de DNA dirigidos al Factor de Iniciaci?n 2 (IF2) durante la traducci?n bacteriana en Escherichia coli?

Abstract

La creciente propagaci?n de bacterias multidrogo resistentes ha repercutido en la crisis global de resistencia a antibi?ticos que enfrentamos hoy en d?a. Es imperativo el desarrollo de f?rmacos con novedosos blancos que puedan burlar los sistemas de evasi?n a antibi?ticos adquiridos. Los apt?meros, como alternativa para evitar la propagaci?n bacteriana, son secuencias cortas de ?cidos nucleicos de una sola hebra seleccionados por su alta afinidad a mol?culas diana espec?ficas, a las que se unen adoptando una conformaci?n tridimensional. Estos tienen un alto potencial farmacol?gico al usarlos como mol?culas inhibidoras de otras implicadas en procesos vitales. IF2 es una prote?na multidominios que juega un rol esencial en la iniciaci?n de la traducci?n bacteriana: recluta al tRNA de iniciaci?n a trav?s del dominio C2, promueve el emparejamiento de bases cod?n-anticod?n y la asociaci?n de la subunidad 50S al complejo 30S IC, hidroliza GTP mediante el dominio G2 y permite la maduraci?n del 70S IC en 70S EC. Se han identificado previamente apt?meros dirigidos a IF2 planteando bloquear sus funciones en el marco de la s?ntesis proteica. En el presente trabajo, se seleccion? al apt?mero 311 (Apt311) para evaluar las posibles perturbaciones que causa en IF2 con respecto a la iniciaci?n de la traducci?n mediante par?metros cin?ticos usando el sistema FRET in vitro y aproximaciones in silico. Los resultados demostraron que el Apt311 perturba el reclutamiento del tRNAi de IF2 y su posterior acomodaci?n en el sitio P de la subunidad ribosomal 30S durante la formaci?n del complejo 30S IC. Asimismo, el Apt311 impide la asociaci?n de la subunidad 50S y, por ende, la formaci?n del complejo 70S IC. En efecto, el Apt311 es una mol?cula con potencial antibi?tico que inhibe las funciones fundamentales de IF2 en la iniciaci?n de la traducci?n probablemente debido a su uni?n a nivel de los dominios C1 y G3 de IF2, impidiendo la comunicaci?n alost?rica entre los dominios G2 y C2