Title: Evaluación in silico de interacciones de anticuerpos monoclonales y nanocuerpos de camélidos sobre la proteína beta-amiloide en el diagnóstico de la enfermedad de Alzheimer
OCDE field: https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#2.06.00
Issue Date: 5-May-2022
Institution: Universidad Católica de Santa María
Abstract: Introducción. Desde el descubrimiento de los anticuerpos monoclonales (mAbs) y nanocuerpos
(VHH), nuevas investigaciones buscan la aplicación de la inmunología en el diagnóstico de la
Enfermedad de Alzheimer (EA), teniendo como blanco de interacción la proteína beta-amiloide
(ßA), sin embargo, sus resultados aún son expectantes. El objetivo del estudio fue evaluar las
interacciones de anticuerpos monoclonales (Solanezumab, Gantenerumab y Crenezumab) y
nanocuerpos de camélidos (llama, vicuña y camello) sobre las estructuras de la proteína betaamiloide
para el diagnóstico de la Enfermedad de Alzheimer, mediante herramientas
computacionales.
Materiales y Métodos. Fue un estudio experimental in silico, las estructuras se obtuvieron del
Protein Data Bank (PDB), la simulación de dinámica molecular (DM) se realizó en el software
GROMACS v.5.0.5., RMSD (Root mean square deviation), radio de giro (RG) y diagrama de
Ramachandran validaron las estructuras, Se hizo un análisis de las fluctuaciones después de la
interacción. La predicción de drogabilidad y acoplamiento se realizaron en los servidores
PockDrug y PatchDock respectivamente.
Resultados. Las estructuras PDB de mAbs fueron 4XXD (Solanezumab), 5VZY (Crenezumab),
5CSZ (Gantenerumab), de nanocuerpos 1I3V (Llama), 5J57 (Vicuña) y 5U64 (Camello) y de
ßA fueron 1IYT (Monómero), 2NAO (Trímero) y 5OQV (Tetrámero, Pentámero y Estructura
Fibrilar). La DM fue de 10ns; los valores del RMSD, fluctuación RMS, RG y Ramachandran
indicaron su buena calidad, estabilidad y naturalidad. El acoplamiento molecular indicó las
zonas de interacción y la energía atómica de contacto entre mAbs y VHH frente a las formas de
ßA, con un valor entre -3.12 y -17.15 kcal/mol.
Conclusión. Se validó los modelos estructurales, la variación conformacional y energía
generada por las interacciones moleculares entre los mAbs y VHH frente a las estructuras de la
proteína ßA, mediante herramientas computacionales. Este estudio contribuye en el
planteamiento de nuevos métodos diagnósticos para la EA.
Discipline: Medicina Humana
Grade or title grantor: Universidad Católica de Santa María.Facultad de Medicina Humana
Grade or title: Médico Cirujano
Juror: Del Castillo Solorzano, Noemi; Llerena Concha, Yolanda Angelica; Salcedo Catacora, Mario Enrique
Register date: 10-May-2022