Obtención del genoma nuclear de Eugenia uniflora L. (Myrtaceae) para la identificación de terpeno sintasas

Abstract

Obtención de un genoma de referencia para E. uniflora que permita identificar los miembros de la familia de las terpeno sintasas (TPS) que son responsables de la síntesis de terpenos de esta especie. El ensamblaje de novo del genoma, a partir de lecturas secuenciadas utilizando la plataforma Illumina, permitió obtener un tamaño total de 385.1 Mbp con un valor de N50 igual a 26 199 bp. Asimismo, la predicción génica utilizando como referencia proteínas de Viridiplantae permitió obtener 30 663 genes codificadores de proteínas de pitanga. Un análisis de genómica comparativa con otras especies de plantas permitió identificar 2 219 genes específicos de E. uniflora, de los cuales el 40% fueron anotados funcionalmente con 1 772 términos ontológicos. Por otro lado, utilizando la información de la anotación de los genes predichos, se identificaron 20 genes de TPS que representan a las subfamilias TPS-b, TPS-c, TPS-f y TPS-g. Los datos generados en este trabajo permitirán comprender y conocer los mecanismos moleculares involucrados en la adaptabilidad a ambientes naturales y en la síntesis de compuestos con importancia farmacológica en pitanga.