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Jaramillo, L., (2017). Firma genómica para genotipificación de Mycobacterium tuberculosis [Tesis, Universidad Nacional Mayor de San Marcos]. https://hdl.handle.net/20.500.12672/7115
Jaramillo, L., Firma genómica para genotipificación de Mycobacterium tuberculosis [Tesis]. PE: Universidad Nacional Mayor de San Marcos; 2017. https://hdl.handle.net/20.500.12672/7115
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Title: Firma genómica para genotipificación de Mycobacterium tuberculosis
Authors(s): Jaramillo Valverde, Luis José
Advisor(s): García de la Guarda, Ruth Hortensia
OCDE field: https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03; https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
Issue Date: 2017
Institution: Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Abstract: Propone un nuevo conjunto de 10 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) utilizando un total de 249 genomas de Mycobacterium tuberculosis (MTB), que por primera vez se seleccionaron basándose en el principio de inclusión/exclusión (IE) utilizando datos de Spoligotyping y filogenia, seguido de la selección de SNPs no sinónimos presentes en clúster de grupos ortólogos (COG) más conservados de cada genotipo de MTB. La asignación del genotipo utilizando el nuevo conjunto de 10 SNPs fue validado con 34 genomas de MTB adicionales y los resultados mostraron una correlación del 100% con sus genotipos ya conocidos. Nuestro conjunto de 10 SNPs no ha sido reportado previamente y abarca los genotipos de MTB que son más prevalentes en todo el mundo. Este conjunto de SNPs proporciona una resolución superior a las técnicas actuales y podría ser utilizado en epidemiología molecular con marcadores resistentes a fármacos, determinando los factores de riesgo en la transmisión de la tuberculosis en diferentes poblaciones para desarrollar estrategias para el control de esta enfermedad.
Link to repository: https://hdl.handle.net/20.500.12672/7115
Discipline: Biología Molecular
Grade or title grantor: Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Unidad de Posgrado
Grade or title: Magíster en Biología Molecular
Juror: Gutiérrez Moreno, Susana Mónica; Mayta Huatuco, Egma Marcelina; Ramírez Roca, Pablo Sergio; Sánchez Venegas, Jaime Roberto
Register date: 9-Mar-2018
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