Perfiles de expresión génica asociados a pronóstico en cáncer gástrico con inestabilidad de microsatélites

Abstract

Evalúa e identifica genes cuyos perfiles de expresión se desempeñen como marcadores pronósticos clave en el cáncer gástrico con inestabilidad de microsatélites. El cáncer gástrico constituye uno de los tipos de cáncer más agresivos e importantes a nivel global. Ha sido objeto de diversas iniciativas de clasificación a lo largo del tiempo, entre ellos, los estudios del The Cancer Genome Atlas y del Asian Cancer Research Group. Estos estudios identificaron al subtipo de inestabilidad de microsatélites, que se caracterizan por presentar alteraciones en el sistema de reparación de bases mal pareadas en el ADN y un pronóstico favorable. Sin embargo, algunos pacientes presentan complicaciones. Además, estas clasificaciones moleculares permiten una mejor comprensión de la heterogeneidad del cáncer gástrico a diferencia de los sistemas actuales de clasificación que sólo están centrados en la extensión anatómica. En tiempos de la medicina de precisión, estos sistemas presentan limitaciones y necesitan ser refinados. En el estudio, se presenta datos de clínicos y de transcriptoma de The Cancer Genome Atlas (n=68) y Asian Cancer Research Group (n=68) obtenidos de los repositorios virtuales del Firebrowse y del Gene Expression Omnibus, respectivamente. Los pacientes fueron dicotomizados en grupos de expresión génica alta y baja. La asociación con tasas de supervivencia se analizó mediante regresiones de Cox. Asimismo, se utilizó la expresión para predecir el microambiente tumoral y las vías biológicas. En cuanto a los resultados, la expresión alta del gen MAP4K4 está asociada con la supervivencia (HR>1, p<0,05, AUC>0,5). Asimismo, encontramos un enriquecimiento de fibroblastos asociados al cáncer y actividad alta de la respiración mitocondrial. Se concluye que la expresión alta del gen MAP4K4 se asocia con tasas más bajas de supervivencia global y libre de enfermedad. Además, dicho perfil de expresión contribuye a la composición del microambiente y altera el estado metabólico del tumor.