Estructura genética poblacional y tendencia genética de peso vivo al nacimiento en alpacas del banco de germoplasma de Quinsachaya del INIA en Puno

Abstract

Con el fin de contribuir a la adecuada gestión del Banco de Germoplasma de Camélidos de Quimsachata (INIA - Puno), se realizó un estudio de la estructura genética de su población de alpacas durante los años 1998 a 2012. Los objetivos específicos fueron i) analizar la estructura genética de la población mediante análisis genealógico y ii) determinar la tendencia genética para peso vivo al nacimiento. Se elaboró un archivo de datos fenotípicos y de genealogía, tomándose como variable de estudio el peso vivo. Para el análisis de la estructura genética se usaron los programas Endog v4.8 y Poprep. Se utilizó un modelo animal que incluye como efectos fijos al sexo, color, mes y año de nacimiento y como covariable la edad de la madre al parto; y como efectos aleatorios el efecto genético directo y el materno para estimar los parámetros genéticos y los valores genéticos para peso vivo al nacimiento. Las soluciones del modelo animal fueron obtenidas mediante el programa Asreml v3.0, luego se calculó el promedio de estos valores por año de parición y se graficó la tendencia genética anual. Se halló una mayor información genealógica por el lado materno que por la vía paterna. El promedio de generaciones máximas, completas y equivalentes fueron de 1.33, 0.52 y 0.85, respectivamente; y el coeficiente de consanguinidad promedio de la población fue de 0.04 %. El tamaño efectivo poblacional fue de 124 ± 54 cabezas. El intervalo generacional mediante las dos vías, edad promedio de los padres al nacimiento de su progenie que serán seleccionados como reproductores y edad promedio de los padres al nacimiento de toda su progenie, fueron de 5.2 y 5.68 años, respectivamente. La heredabilidad directa para peso vivo al nacimiento fue de 0.37 ± 0.03 al incluirse en el modelo solo el efecto genético aditivo directo, y de 0.04 ± 0.03 al incorporarse al efecto genético materno. Los resultados de los parámetros poblacionales indican que no existen riesgos de niveles elevados de consanguinidad, y que el manejo fue adecuado con los propósitos de conservación en el banco. La tendencia genética de peso vivo al nacimiento se mantuvo estable en el periodo de estudio

A study of the genetic structure of the population of alpacas during the years 19982012 was carried out in order to improve the management of Germplasm Bank of Camelids in Quimsachata (INIA, Puno). The specific objectives of the study were i) to analyze the genetic structure of the population by pedigree analysis and ii) to determine the genetic trend for birth weight. Phenotypic and genealogy data were built, the response variable was birth weight. The Endog v4.8 and Poprep softwares were used for analyzing the genetic structure. An animal model was used to estimate genetic parameters and breeding values for birth weight, where sex, color, month and year of birth and age of dam at calving as covariate, were considered as fixed effects, and of direct genetic and maternal genetics as random effects. Animal model solutions were obtained using Asreml v3.0. The average of breeding value were calculated by calving year, and annual genetic trend was plotted. It was found greater genealogical information for maternal side than for paternal side. The average maximum, complete and equivalents generations were 1.33, 0.52 and 0.85, respectively, and the average inbreeding coefficient was 0.04%. The effective population size was 124 ± 54 heads. The generation interval calculated in two ways, a) the average age of parents at the birth of offspring kept for reproduction, and b) average age of parents at the birth of its progeny, were 5.2 and 5.68 years, respectively. The direct heritability for birth weight was 0.37 ± 0.03 when only the direct additive genetic effect was included in the model, and 0.04 ± 0.03 when the maternal genetic effect was added in the model. The population parameters indicated that there was not high inbreeding risk, and the management was appropriate to conservation practice in the Germplasm Bank. The genetic trend showed that breeding values for birth weight remained stable throughout the study period.