Bibliographic citations
Villanueva, J., (2018). Análisis de la diversidad genética de Hemileia vastatrix de Quillabamba mediante secuenciación de las regiones ITS del ADN ribosomal [Universidad Nacional Agraria La Molina]. https://hdl.handle.net/20.500.12996/3621
Villanueva, J., Análisis de la diversidad genética de Hemileia vastatrix de Quillabamba mediante secuenciación de las regiones ITS del ADN ribosomal []. PE: Universidad Nacional Agraria La Molina; 2018. https://hdl.handle.net/20.500.12996/3621
@misc{sunedu/3013759,
title = "Análisis de la diversidad genética de Hemileia vastatrix de Quillabamba mediante secuenciación de las regiones ITS del ADN ribosomal",
author = "Villanueva Cáceda, Juan José",
publisher = "Universidad Nacional Agraria La Molina",
year = "2018"
}
Se estudió la diversidad genética del patógeno Hemilia vastatrix por medio del análisis de la región ITS del ADN ribosomal. La extracción del ADN se realizó con el protocolo descrito por Goodwin y Lee (1993) y Cristancho et al. (2007) con algunas modificaciones, a partir de uredosporas aisladas de hojas infectadas de Coffea arabica, las que fueron seleccionadas al azar en cinco fincas localizadas en la zona productora de Quillabamba (Región Cusco). La amplificación de la región ITS se realizó mediante la técnica de PCR, los fragmentos obtenidos fueron separados utilizando electroforesis en gel de agarosa al uno por ciento. La purificación desde el gel del producto de amplificación se realizó utilizando el kit “QIAquick gel extraction”. La clonación de dicho fragmento se logró por transformación de una cepa de E. coli competente empleando el kit “pGEM®-T Easy Vector Systems” (PROMEGA). El aislamiento de las colonias transformadas se realizó en el medio LB más ampicilina. Para la extracción del plásmido de la bacteria se utilizó el kit “Wizard®Plus SV Minipreps DNA Purification System”. Los plásmidos obtenidos fueron enviados a GenBioteck (Argentina) para su secuenciación. A partir de 49 secuencias se identificaron 38 haplotipos (h=38), con diversidad haplotípica (Hd=0.977 ± 0.012), diversidad nucleotídica (π=0.0054 ± 0.00038) e índice de Tajima (D = -2.35287, p<0.01). Los resultados sugieren que H. vastatrix es una población que está en crecimiento con una alta proporción de haplotipos únicos.
This item is licensed under a Creative Commons License