Buscar en Google Scholar
Registro completo de metadatos
Mamani Zapana, Enrique Walter
Kreuze Rockström, Jan Frederik
De Souza Pacheco, Joao Adhemir
2021-03-03T20:34:38Z
2021-03-03T20:34:38Z
2021-03-03T20:34:38Z
2021-03-03T20:34:38Z
2020
De Souza, Joao. (2020). Caracterización molecular de un nuevo nepovirus encontrado en papa (Solanum tuberosum L.) mediante la tecnología de secuenciación profunda (Deep Sequencing). [Tesis de maestría, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Unidad de Posgrado]. Repositorio institucional Cybertesis UNMSM.
https://hdl.handle.net/20.500.12672/16158
Se obtuvo el genoma bipartito completo (ARN1 y ARN2) de un nuevo nepovirus que infecta a la papa, utilizando la secuenciación y ensamblaje de ARN pequeños, a lo que se le complementó con la secuenciación de Sanger. El ensamblaje de las secuencias para el ARN1 dio 7154 nts y para el ARN2 4527 nts, excluyendo la cola poli A. Cada ARN codifica para una sola poliproteína, flanqueada por regiones 5 'y 3' no traducidas (UTR), esta última seguida por una cola poli A. Las poliproteínas codificadas por el ARN1 y el ARN2 tienen conjuntos de motivos que son característicos de virus en el género Nepovirus. Se encontró que la poliproteína del ARN1 tiene los dominios para una helicasa, una proteína de unión al genoma viral, una proteinasa y una ARN polimerasa dependiente de ARN Por otro lado, la poliproteína del ARN2 tiene los dominios para la proteína de movimiento y para la cubierta proteica. Las comparaciones de secuencias usando la región Pro-Pol y la proteína de la cubierta, incluido el análisis filogenético de estas regiones, mostraron relaciones más cercanas con los nepovirus (71% y 34% de identidad en aminoácidos, respectivamente). Los datos obtenidos apoyan el estado taxonómico de este nuevo virus (llamado tentativamente Potato virus B, PVB) como miembro del género Nepovirus, subgrupo B.
application/pdf
spa
Universidad Nacional Mayor de San Marcos
info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio de Tesis - UNMSM
Virus - Aspectos genéticos
Genomas
Virus - Identificación
Virus con ARN
ARN polimerasas
Papas (Tubérculos) - Enfermedades y plagas
Caracterización molecular de un nuevo nepovirus encontrado en papa (Solanum tuberosum L.) mediante la tecnología de secuenciación profunda (Deep Sequencing)
info:eu-repo/semantics/masterThesis
Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Unidad de Posgrado
Biología Molecular
Magíster en Biología Molecular
PE
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.02
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03
https://purl.org/pe-repo/renati/level#maestro
02414092
https://orcid.org/0000-0003-4127-1248
41436466
511027
Alzamora Gonzales, Libertad
Jara Peña, Enoc Efer
Sandoval Peña, Gustavo Adolfo
Ramírez Malaver, Jorge Luis
https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis
Pública



Este ítem está sujeto a una licencia Creative Commons Licencia Creative Commons Creative Commons