Análisis de diversidad genética poblacional de Aniba rosaeodora ducke "palo de rosa" en la amazonía peruana empleando marcadores ISSR

Abstract

Aniba rosaeodora Ducke “palo de rosa” es un árbol forestal amazónico en peligro de extinción, que posee “Linalool” un compuesto aromático con alto valor económico en la industria de la perfumería fina. Para evaluar la diversidad genética de esta especie se colectaron 90 genotipos provenientes de 8 poblaciones y se emplearon 11 marcadores ISSR. El ADN aislado fue de óptima calidad, así lo demuestra la prueba electroforética y espectrofotométrica. A partir de ello, se amplificaron 11 marcadores ISSR, obteniendo 375 bandas polimórficas y un PIC promedio de 0,774. El promedio del número efectivo de alelos (Ne), la diversidad genética de Nei (He) y el índice informativo de Shannon (I) fue 1,485, 0,294 y 0,453 respectivamente. El resultado del AMOVA, reveló una alta variación genética dentro de las poblaciones (88%) y baja entre las poblaciones (12%). La estructura genética, el Neighbor Joining y el análisis principal de coordenadas, agruparon los 90 genotipos de Aniba rosaeodora Ducke en tres grupos (A, B y C). Se calcularon diversos parámetros de diversidad a nivel inter poblacional que reveló una mayor diversidad genética en el grupo A debido al mayor flujo de genes. El análisis Neighbor Joining unió los grupos A y B, mientras que el grupo C se encontró bastante divergente. La estructura genética, revelo que los genotipos Mairiricay (13 y 15) y Tamshiyacu 3, tienen un mayor nivel de diversidad genética. Finalmente, estos resultados son cruciales para planificar y diseñar estrategias de manejo y conservación de Aniba rosaeodora Ducke en la Amazonia Peruana.

Aniba rosaeodora Ducke "rosewood" is an Amazon forest tree in endangered, which has "Linalool" an aromatic compound with high economic value in the fine perfume industry. To evaluate the genetic diversity of this species, 90 genotypes from 8 populations were collected and 11 ISSR markers were used. The isolated DNA was of excellent quality, as demonstrated by the electrophoretic and spectrophotometric test. From this, 11 ISSR markers were amplified, obtaining 375 polymorphic bands and an average PIC of 0.774. The average of the effective number of alleles (Ne), the genetic diversity of Nei (He) and the informative index of Shannon (I) were 1,485, 0,294 and 0,453 respectively. The result of the AMOVA revealed a high genetic variation within the populations (88%) and low among the populations (12%). The genetic structure, the Neighbor Joining and the main coordinate analysis, grouped the 90 genotypes of Aniba rosaeodora Ducke into three groups (A, B and C). Several diversity parameters were calculated at the inter-population level, which revealed a greater genetic diversity in the group A due to the greater gene flow. The Neighbor Joining analysis united groups A and B, while group C was found to be quite divergent. The genetic structure revealed that the Mairiricay (13 and 15) and Tamshiyacu 3 genotypes have a higher level of genetic diversity. Finally, these results are crucial to plan and design management and conservation strategies for Aniba rosaeodora Ducke in the Peruvian Amazon.