Diversidad de comunidades microbianas en suelos y aguas del área de concesión para la conservación cuenca alta río Itaya, Iquitos-Perú 2020

Abstract

Metagenomic analysis is very valuable because it allows us to obtain the genetic information of the microorganisms present in a sample. The main objective was to determine the diversity of microbial communities in the soils and waters of the Upper Itaya River Basin Conservation Concession Area (CCCARI). The selection criteria for the soil samples were their typology, topography and relief; for the water samples, these were collected from cochas streams and the Itaya River, and the physicochemical parameters of both samples were determined. Metagenomic DNA from soils and water were purified with standard methods, libraries were prepared and then sequenced on the Illumina NextSeq™ 550 platform. The sequences were processed using the MG-RAST server. The results indicate that the soils are of loam and slightly acidic textural class. The water samples exhibited physicochemical characteristics typical of black waters. Additionally, the massive sequencing indicates a high microbial diversity in the soils and waters of the CCCARI with a predominance of bacteria. Taken together, these results indicate that the microbial diversity recorded in the CCCARI soil and water samples is partly attributed to the physicochemical characteristics of these environments.

El análisis metagenómico es muy valioso, ya que nos permite obtener la información genética de los microorganismos presentes en una muestra. El objetivo principal, fue determinar la diversidad de las comunidades microbianas en los suelos y aguas del Área de Concesión para la Conservación Cuenca Alta río Itaya (CCCARI). El criterio de selección de las muestras de suelos fue su tipología, topografía y relieve, para las muestras de agua, estas fueron colectadas de quebradas cochas y el río Itaya, se determinaron los parámetros fisicoquímicos de ambas muestras. El ADN metagenómico de suelos y aguas fueron purificados con métodos estándares, se prepararon las librerías para luego ser secuenciados en la plataforma de Illumina NextSeq™ 550. Las secuencias se procesaron utilizando el servidor MG-RAST. Los resultados indican que los suelos son de clase textural franco y ligeramente ácidos. Las muestras de agua presentaron características fisicoquímicas típicas de aguas negras. Adicionalmente, el secuenciamiento masivo nos indica una alta diversidad microbiana en los suelos y aguas del CCCARI con predominancia de bacterias. En conjunto, estos resultados nos indican que la diversidad microbiana registrada en las muestras de suelo y aguas del CCCARI en parte se atribuyen a las características fisicoquímicas de estos ambientes.