Caracterización y variación molecular en Diatraea saccharalis en Saccharum officinarum de las regiones La Libertad y Lima, Perú – 2018

Abstract

RESUMEN La presente investigación tuvo como objetivo la caracterización y variación molecular de las tres poblaciones de Diatraea saccharalis Fabricius proveniente del cultivo de Saccharum officinarum L. “caña de azúcar” de las regiones La Libertad y Lima haciendo uso de RAPDS. Para esto se utilizaron los marcadores OPA-08, OPA-11, OPC-11, OPP-17 y GyakuU-13. Primero se hizo extracción de ADN total con ayuda de Kit comercial a los cuales luego se realizó PCR con las siguientes condiciones: desnaturalización del ADN inicial fue de 94ºC por 3 minutos. Este paso fue seguido por 30 ciclos de amplificación (94ºC: 1 min, 35ºC: 1 min, 72ºC: 1:30 min.). Después de los ciclos, se realizó una extensión final de 3 minutos a 72 ºC. Los resultados de PCR fueron observados en geles de poliacrilamida al 4%. Se observó que OPA8 generó 18 bandas, OPA11 23 bandas, OPP17 12 bandas, el marcador OPC11 19 bandas y Gyaku13 23 bandas. Con esto se llenaron matrices de presencia y ausencia que luego fueron ingresadas en el programa Popgene32 para realizar los diferentes análisis estadísticos, obteniéndose que las poblaciones no se diferencian genéticamente entre ellas pero si dentro de ellas, del mismo modo se observó en los dendogramas un agrupamiento entre las poblaciones de Casa Grande y Barranca. Se llega a la conclusión que dentro de cada población existen sub grupos e individuos diferenciados genéticamente.