Uso del programa de bioinformática que transforman los informes del banco de datos por homología para la generación de una estructura espacial de proteína

Abstract

En esta investigación se reporta la predicción del plegamiento globular de la cadena polipeptídica de los aminoácidos que conforman la estructura terciaria de la proteína fosducina de la retina de un bovino, activado por la radiación luminosa durante el proceso de la visión. Se ha utilizado algoritmos del programa de bioinformática que transforman los informes del banco de datos por homologa para la generación de una estructura espacial de proteína, con el programa Swiss-Model y el banco de datos “Protein Data Bank”, accesible vía página Web como el servidor de ExPasy o el programa DeepView, Pdb-Expectador suizo. En primer lugar, se modelo por análisis de aminoácidos a la estructura primaria de fosducina, obteniéndose una estructura secundaria conformada por ocho hélices, cinco grupos de hojas beta y 16 giros beta. Las hélices α y hojas β fueron generados por efecto de polarización de los aminoácidos que rotan a través de la cadena polipeptídica. Se predijo la formación de la estructura terciaria de la proteína fosducina como plegamiento globular compacta de las hélices α, hoja β y de los 16 giros de los aminoácidos, se originó mayor acumulación de los electrones en el entorno del plegamiento globular, siendo más probable la mayor acumulación del flujo de información biológica para ser transmitida a otra proteína.