Detección molecular de coronavirus a partir del gen n en crías de alpaca (Vicugna pacos) en el CICAS La Raya provincia de Canchis-Cusco

Abstract

En el presente trabajo de investigación se determinó la presencia de coronavirus a partir de necropsias realizadas a crías de alpaca del CICAS La Raya; para este propósito se extrajo porciones intestinales del sistema digestivo, correspondientes al colon ascendente, transverso, descendente, duodeno, íleon, yeyuno y recto. Se colectó un total de 113 muestras en cadena de frío y luego se llevaron a congelación; a partir de éstas se seleccionaron por observación directa dos tipos diferentes de muestras: 44 muestras de material entérico y 69 muestras con contenido fecal, teniendo en cuenta que ambos tipos diferentes de muestras contenían en una misma porción intestinal. Para realizar la amplificación del ADN por PCR en punto final se utilizaron un set de primers, previamente seleccionados con una especificidad de 96,6% y una sensibilidad de 95,1%, con el objetivo de amplificar el fragmento de 407 pb del gen N que codifica la nucleocapside viral. A continuación se corrió una electroforesis horizontal en un gel de agarosa preparado al 2%, durante 50 minutos a 70 V. Una vez obtenido el gel se mantuvo con bromuro de etidio durante 5 minutos, para finalmente identificar la presencia de bandas en el fotodocumentador de imágenes VILVERT E-BOX. Como resultado se identificó la presencia de coronavirus en 35 muestras de crías de alpaca, lo cual revela una frecuencia de 46.6% del virus, como agente causante de mortalidad y morbilidad de crías de alpaca en la región Canchis - Cusco.