Caracterización molecular de la microbiota bacteriana y fúngica de hojas sanas y con síntomas de enfermedades de manchas foliares de banano mediante técnicas dependientes e independientes de cultivo

Abstract

Las enfermedades de manchas foliares del banano son un serio problema para la industria del banano. Las enfermedades causadas por las manchas foliares del banano están asociadas a un complejo de hongos patógenos, de los cuales sigatoka es considerada la enfermedad foliar más devastadora del cultivo de banano, causado por el hongo Pseudocercospora fijiensis responsable de la necrosis de las hojas del banano. En el presente estudio, un enfoque de metagenómica dirigida y comparativa ha sido aplicado para caracterizar las comunidades bacterianas y fúngicas en la filósfera a partir de hojas de plantas con ausencia y presencia de síntomas de enfermedades de manchas foliares. Bacterias y hongos han sido aisladas e identificadas molecularmente basadas en la secuencia parcial del gen ADNr 16S y ITS. La clasificación taxonómica revelo cuatro y nueve Fylum bacterianos conocidos en tejidos de hojas con ausencia y presencia de síntomas respectivamente. El análisis de las comunidades bacterianas reveló 110 OTUs de bacterias. La microbiota bacteriana en hojas sanas fue compuesta principalmente con Zymobacter que estuvo presente solo en hojas sanas, seguido de Pantoea y Bacillus. En hojas de plantas con síntomas los géneros más representativos fueron Bacillus, Halospirulina y Erwinia, mientras Rubritepida estuvo presente solo en plantas enfermas. La diversidad fúngica de plantas enfermas reveló 63 OTUs, con los géneros Cladosporium y Alternaria como los más representativos y Pseudocercospora antes conocido como Mycosphaerella siempre estuvo presente en hojas de plantas enfermas. Nuestros resultados demuestran que gracias los análisis metagenómicos permite entender las relaciones entre las comunidades microbianas y fúngicas en el microbioma foliar y proporcionar posibles estrategias de control biológico de las enfermedades de manchas foliares del banano.