Estudio de la interacción del receptor de GLP – 1 con la GLP – 1 y diversos metabolitos secundarios en el maíz morado mediante simulación molecular

Abstract

GLP – 1 es una hormona incretinica que tiene como tarea estimular la secreción de insulina dentro de las células β presentes en el páncreas, en el presente trabajo se realizó un estudio in sillico investigando la interacción entre esta hormona, su receptor intermembranal y de diferentes metabolitos secundarios del maíz morado mediante dinámica molecular. Primero se realizó una dinámica molecular únicamente de la hormona a 100ns y del receptor intermembranal a 100ns, posteriormente un acoplamiento molecular entre GLP – 1 y su receptor, de la misma manera un acoplamiento molecular entre cada metabolito secundario del maíz morado y el receptor intermembranal de GLP – 1. Obteniendo como resultado 12 estructuras cuaternarias a las cuales se les realizaron dinámica molecular de 100ns cada una en condiciones fisiológicas. La evaluación de la energía libre de enlace se llevó a cabo mediante la mecánica molecular de área superficial de Poisson-Boltzmann (MM/PBSA). Este enfoque se empleó para analizar la variación en la afinidad del receptor de GLP-1 en relación con cada estructura acoplada.. Los resultados muestran que, de los 10 metabolitos secundarios utilizados en este trabajo, solo 8 presentaron energías favorables, dando a entender que hubo una unión espontanea, siendo el que presentaba mejor energía Cianidina-3-O(3,6-O-dimalonilglucosido) - CDM. Para las hormonas GLP – 1 y GLP – 1 Amida, se encontraron energías de unión bastantes favorables, aunque CDM supero la energía de unión de GLP – 1 mas no de GLP – 1 Amida, siendo posible que estos 8 metabolitos y en especial CDM tengan potencial como análogos de GLP – 1.