Detección de Escherichia coli productora de Betalactamasas de Espectro Extendido en Primates No Humanos mantenidos en semicautiverio en las Islas Iquitos, Muyuy y Padre Isla, de la Cuenca Amazónica Peruana

Abstract

Detecta Escherichia coli productora de BLEE en PNH mantenidos en semicautiverio en las islas Iquitos, Muyuy y Padre Isla, de la Cuenca Amazónica Peruana, mediante métodos microbiológicos, moleculares y genómicos. En agosto del 2022, se colectaron 69 muestras fecales de Saguinus mystax, Saguinus labiatus y Saimiri boliviensis, mediante muestreo aleatorio estratificado, y se enviaron al Laboratorio de Biología y Genética Molecular de la Facultad de Medicina Veterinaria de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos para su análisis. Se identificaron 55 aislados de E. coli en total, mediante agar MacConkey, agar EMB y pruebas bioquímicas, y se evaluaron sus perfiles de resistencia mediante el método de Kirby-Bauer, de acuerdo con los lineamientos del CLSI. Los aislados sospechosos de BLEE se confirmaron mediante el método de Jarlier y se realizó la secuenciación de sus genomas completos, empleando la plataforma MiSeq de Illumina. El 5.45% (3/55) de los aislados expresaron fenotipo BLEE. Todos los aislados productores de BLEE fueron MDR y uno de ellos expresó fenotipo hipermucoviscoso. Además, se identificaron dos variantes del gen blaCTX-M: blaCTX-M-15 y blaCTX-M-55, que codifican CTX-M-15 y CTX-M-55 respectivamente, y dos aislados fueron reconocidos como ST10, un linaje pandémico de alto riesgo. El análisis filogenómico demostró su estrecha relación con cepas humanas y de animales domésticos, resaltando el impacto negativo del hombre y de las actividades antropogénicas en la interfaz humano-animalmedio ambiente. Los resultados confirman que el 4.35% (3/69) de los PNH que habitan en esta región son portadores de E. coli productora de BLEE, y sugieren que podrían actuar como diseminadores en la Amazonía Peruana.