Identificación molecular y caracterización in silico de las proteínas desintegrinas del veneno de cuatro especies ofídicas de importancia clínica

Abstract

Identifica y caracteriza molecularmente las desintegrinas presentes en el veneno de las especies de serpientes Bothrops atrox, Bothrops pictus, Bothrops barnetti y Bothrops brazili. Las desintegrinas son una familia de proteínas pequeñas no enzimáticas generadas mediante la escisión proteolítica de la metaloproteinasa de veneno de serpiente tipo II. Estas desintegrinas desempeñan un papel crucial en diversos procesos biológicos, como la adhesión celular, migración, apoptosis, inhibición de la agregación plaquetaria y angiogénesis. Para desarrollar el estudio, el proceso abarcó el aislamiento de ARN, su conversión a ADNc, amplificación y análisis de secuencias mediante electroforesis y secuenciación. La obtención de secuencias de aminoácidos se realizó a través del programa Translate Tool - ExPASy, seguido de un alineamiento múltiple con Clustal Omega. Se predijeron propiedades fisicoquímicas y estructura secundaria mediante ProtpPparam y PRABI, respectivamente, y se determinó la estructura tridimensional. Los resultados revelaron la presencia de desintegrinas en las cuatro especies analizadas, con secuencias aminoacídicas de aproximadamente 200 pb. Cabe destacar que la desintegrina de B. pictus mostró un inserto de tres aminoácidos cerca de la región N-terminal, también presentes en los dominios similares a desintegrinas de metaloproteinasas tipo III, sugiriendo el origen de la desintegrina de B. pictus a partir de la duplicación de un dominio similar a desintegrina. El peso molecular aproximado de las desintegrinas fue de 7.5 kDa. En cuanto a la estructura secundaria, se observaron predominantemente plegamientos azarosos (~ 90 %), con 6 puentes disulfuro en la estructura tridimensional, compartiendo la misma ubicación que las desintegrinas del grupo 4. Además, los motivos de unión a integrinas (RGD) se localizaron dentro de bucles. En conclusión, las cuatro especies analizadas expresan desintegrinas en su veneno, mostrando homología en estructura primaria, secundaria y tridimensional con otras desintegrinas reportadas en la base de datos.