Evaluación del método directo para la identificación y antibiograma de Enterobacterias en Urocultivo de pacientes con bacteriuria significativa atendidos en el Hospital Docente Madre Niño San Bartolomé 2013-2014

Abstract

Objetivo: Evaluar el método directo en la identificación y antibiograma de Enterobacterias en pacientes con bacteriuria significativa atendidos en el Hospital Docente Madre Niño San Bartolomé.

Materiales y Método: Estudio descriptivo de corte transversal. Se procesó 173 muestras de orina con sospecha de bacteriuria significativa, inoculándose directamente la muestra en medios diferenciales y en dos placas de agar Mueller Hinton al que se le colocó 10 antibióticos; paralelamente, se procesó las muestras según el protocolo estandarizados para urocultivo, identificando el uropatógeno por las reacciones presentadas en la serie bioquímica y categorizando los halos de inhibición antibiótica según los puntos de corte vigentes señalada por la CLSI. Finalmente se comparó los resultados por ambos métodos y se calculó el nivel de concordancia mediante el índice Kappa.

Resultados: 154 muestras fueron analizadas y comparadas por ambos métodos, hallándose un índice Kappa de 0.89, siendo considerada una concordancia “Casi perfecta”. En el caso del antibiograma, muestras fueron evaluadas obteniéndose un índice Kappa para el antibiótico Trimetoprim-Sulfametoxazol de 0.97, Ciprofloxacina, 0.82, Gentamicina, 0.94, Ampicilina, 0.92 y Ceftriaxona,0.93 categorizados como una correlación “Casi perfecta”; en el caso de la Cefalotina presentó un índice de 0.64 y Amoxicilina – Ac. Clavulánico de 0.74 que se valoran como una concordancia “Considerable”, para la Nitrofurantoína, se halló un índice de correlación de 0.56 considerada como una concordancia “Moderada” y para la Amikacina, se obtuvo un índice de 0.28 categorizada como “Aceptable”.

Conclusión: El método directo es un protocolo alternativo válido y confiable, que permite reportar en menos tiempo el agente infeccioso y el patrón de susceptibilidad con el cual puede iniciarse una terapia antibiótica adecuada, sin embargo es imprescindible valorar el resultado según la pureza y recuento de colonias, así como también confírmalo con la identificación y antibiograma convencional.

Objetive: Assess the direct method in the identification and susceptibility of Enterobacteriaceae in patients with significant bacteriuria treated at Hospital Madre Niño San Bartolomé.

Materials and Methods: Descriptive cross-sectional study. 173 urine samples with suspected significant bacteriuria were directly processed, by inoculating the sample in differential media and two Mueller-Hinton agar plates to which was placed 10 antibiotic disks in parallel, the samples were processed according to the standardized protocol for urine culture, identifying the uropathogen through the reactions outlined in bacterial biochemistry and categorizing series of antibiotic inhibition halos breakpoints as indicated by the CLSI. Finally the results are compared for both methods and the level of agreement was calculated using the Kappa index.

Results: 154 samples were analyzed and compared by the two methods for the identification, obtaining a Kappa index of 0.89, being considered as an “Almost perfect“ agreement. In the case of the susceptibility test, 149 samples were compared by the two methods, obtaining a Kappa index of 0.97 for the antibiotic Trimethoprim-sulfamethoxazole, 0.82 for Ciprofloxacin, 0.94 for Gentamicin, 0.92 for Ampicillin and 0.93 for Ceftriaxone, being considered as an “Almost perfect“ correlation; Cephalothin present a Kappa index of 0.64 and Amoxicillin - clavulanate 0.74 being considered as a “Substancial“ agreement, as well as Nitrofurantoin Kappa index of 0.56 was considered to have as a “Moderate“ agreement. On the other hand, Amikacin had a “Fair” agreement (Kappa index of 0.28).

Conclusion: The direct method is a valid and reliable alternative protocol, which allows to identify the bacterial infectious agent and find the pattern of antibiotic susceptibility in less time, which can be initiated with appropriate therapy. However, it is essential to evaluate the results according to the purity and counting colonies, as well as identify and confirm the results with conventional susceptibility.

Keywords: direct method, standardized method, kappa coefficient, urine.