Comparación de grupos filogenéticos y genes de resistencia a betalactámicos de Escherichia coli entre aislamientos de muestras clínicas y colonizantes intestinales

Abstract

Compara las diferencias de grupos filogenéticos y genes de resistencia a betalactámicos de Escherichia coli entre aislamientos de muestras clínicas y colonizantes intestinales de portadores sanos. Estudio transversal. Se incluyeron 113 aislamientos de Escherichia coli productoras de betalactamasa de espectro extendido. Estas fueron obtenidas de aislamientos clínicos (67) y de muestras de hisopados anales (46) de pacientes hospitalizados en el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas durante el 2017. Se buscó determinar diferencias significativas entre los grupos filogenéticos de cada grupo (muestras clínicas e hisopados anales). Para esto, se determinó el grupo filogenético mediante el método de Clermont et al., se describió el perfil de resistencia a los antibióticos, los genes de resistencia de acuerdo con los servicios de hospitalización de donde fueron recuperados. El grupo filogenético más frecuente en las muestras clínicas fue el B2 (35,6%) y en las muestras de hisopado fueron D o E (29,5%). Se encontró diferencia significativa entre los grupos filogenéticos y el tipo del aislamiento, siendo las muestras clínicas los de mayor probabilidad de ser filogrupo B1 (OR = 8,78 [IC 95%: 1,08-71,38]). Además, se evidenció una frecuencia de 84% para el gen CTX-M, resistencia a ciprofloxacino (78% para hisopados anales y 91% para muestras clínicas) y gentamicina (51% para muestras clínicas y 61% para hisopados anales) y amikacina (3% para muestras clínicas y 15% para hisopados anales). Se evidencia una gran diversidad en los grupos filogenéticos de Escherichia coli aisladas de muestras clínicas y de hisopados anales. Se demostró que existen diferencias significativas entre los grupos filogeneticos de cepas de Escherichia coli aisladas de muestras clínicas y de hisopados anales. Además, se encontró una alta frecuencia de betalactamasa tipo CTX-M, y una alta frecuencia de resistencia a quinolonas y aminoglucósidos