Aislamiento y caracterización molecular de microorganismos del orden Thraustochytriales provenientes de los manglares de Tumbes

Abstract

Los Thraustochytriales o mejor conocidos como thraustochitridos son protistas pertenecientes al Grupo Chromista según los análisis del gen 18S rRNA. Considerados como una potencial fuente alternativa al aceite de pescado, estos microorganismos oleaginosos han sido aislados de diversos ambientes a nivel mundial encontrándose principalmente asociados a material vegetal en descomposición. Así, en este estudio se logró aislar cepas de thraustochitridos provenientes de todos los puntos muestreados en los manglares de Tumbes donde la caracterización bioquímica con acriflavina y rojo de nilo confirmaron su ocurrencia y los resultados de caracterización molecular permitieron determinar aislados pertenecientes a los géneros Aurantiochytrium (basónimo: Shizochytrium), Parietichytrium, Botryochytrium e Ulkenia sensu stricto. Asimismo se propone el posible descubrimiento de dos nuevas especies con potenciales biotecnológicos en base a información proporcionada de las características observadas en cultivo, de los análisis filogenéticos y de trabajos previos relacionadas a las cepas Aurantiochytrium sp. 15A-14a (Genbank Accesion N° AB811008) y Schizochytrium sp. S8 (Genbank Accesion N° DQ836630), los cuales dieron el mayor hit con los aislados 75, 507, 510, 512, 523, 526, 527 y C1, respectivamente. Finalmente, el presente estudio brindó los primeros reportes de la presencia de estos thraustochitridos en nuestro país.

The Thraustochytriales or commonly known as traustochytrids are protists belonging to the Chromista group determined by the 18S rRNA gene analysis. Considered a potential alternative source of fish oil, these oleaginous microorganisms are widely distributed in various environments around the world. Mainly, they are associated with decaying plant material. Thus, strains of thraustochytrids were isolated in this study. These strains were taken from all sampled points in the mangroves of Tumbes where biochemical characterization acriflavine and red nile confirmed their occurrence and the results of molecular characterization allowed determining isolates belonging to the genera Aurantiochytrium (basionym: Shizochytrium) Parietichytrium, Botryochytrium and Ulkenia sensu stricto. It is also proposed the possible discovery of two new species with potential biotechnological based on information provided by the characteristics observed in culture, phylogenetic analyzes and previous work related to strains Aurantiochytrium sp. 15A-14a (Genbank Accesion N° AB811008) y Schizochytrium sp. S8 (Genbank Accesion N° DQ836630), which showed the best hit along with the isolates 75, 507, 510, 512, 523, 526, 527 y C1, respectively. Finally, this study provided the first reports of the presence of these thraustochitridos in our country.

Key words: Thraustochitrids, Tumbes’s mangroves, senescent leaves and baiting method, 18S rRNA gene, molecular phylogeny, polyunsaturated fatty acids (PUFAs).