Producción del dominio c-terminal del factor de iniciación IF2 de Escherichia coli y Geobacillus stearothermophilus como blanco de posibles aptámeros

Abstract

Introducción: El factor de iniciación IF2 tiene diferentes funciones en la iniciación de la traducción de proteínas. Su dominio C-terminal interacciona fuertemente con fMet-tRNA. El objetivo principal de este estudio es aislar un aptámero específico para IF2 CTD de Geobacillus stearothermophilus y Escherichia coli. Métodos: Se utilizó el sistema de expresión de proteínas basado en E. coli BL21. E. coli BL21 se transformó con un plásmido que contiene la secuencia InfB CTD. La inducción de proteínas se realizó bajo diferentes temperaturas y concentraciones de IPTG para cada proteína. La secuencia Hexa-His se agregó al gen infB permitiendo la purificación por cromatografía de afinidad. Resultados: IF2 CTD se purificó con alto rendimiento y pureza. La concentración de E. coli IF2 (558,0 ng/uL) fue tres veces mayor que la de G. stearothemophilus (144,6 ng/uL). Ambas proteínas se purificaron con una pureza > 95%. Mediante SELEX, se obtuvieron cuatro aptámeros para IF” CTD, de los cuales uno específicamente a IF2 CTD G. stearothemophilus. Conclusión: Se ha desarrollado un protocolo rápido y eficiente de purificación de proteína IF2 CTD, permitiendo la producción de fragmentos termofílicos y mesofílicos de IF2. El aptámero obtenido podría servir como un nuevo mecanismo inhibidor de la síntesis de proteínas en futuros estudios.

Introduction: The initiation factor IF2 has different functions in the initiation of protein translation. Its C-terminal domain interacts strongly with fMet-tRNA. The main objective of this study is to isolate a specific aptamer for IF2 CTD Escherichia coli and Geobacillus stearothermophilus. Methods: A protein expression system based on E. coli BL21 was used. E. coli BL21 was transformed with InfB CTD sequence. Protein induction was performed under different temperatures and IPTG concentration. His-tagged affinity chromatography was used for protein purification since a hexa-His coding sequence was added to the InfB genes. Results: IF2 CTD was purified in high yields and purity. E. coli IF2 fragment protein concentration (558.0 ng/uL) was three times larger than that of G. stearothemophilus (144.6 ng/uL). Purity of both proteins were >95%. A specific aptamer for IF2 CTD G. stearothermophilus was obtained through SELEX. Conclusion: A rapid and efficient protocol for IF2 CTD protein purification has been developed, allowing the production of thermophilic and mesophilic IF2 fragments. The obtained aptamer may serve as a novel antibiotic mechanism in further studies.