Circulating Dengue virus serotypes and clinical characteristics in patients with Acute Febrile Illness from Piura, Peru

Abstract

Título: Serotipos circulantes del virus del dengue y características clínicas en pacientes con síndrome febril agudo del departamento de Piura, Perú. Antecedentes: Las infecciones por dengue son un importante problema de salud y existe una creciente necesidad de fortalecer su vigilancia epidemiológica en el Perú debido a la baja tasa de confirmación de laboratorio (<50%). Objetivo: Evaluar la frecuencia de los serotipos del virus Dengue (DENV) y describir su presentación clínica en pacientes de Piura, una zona endémica del norte de Perú. Metodología: En un total de 213 muestras de suero de ocho centros de salud se estudió la presencia de DENV mediante RT-PCR, antígeno NS1 y anticuerpos IgM de marzo a agosto de 2016. A las muestras positivas para PCR se les realizó secuenciación e identificación de serotipo 1 a 4. Los médicos usaron un cuestionario estandarizado para recolectar la información demográfica y de síntomas clínicos. Resultados: Se detectó ARN del virus del dengue en 28,64% (61/213) de las muestras a través de RT-PCR. Para las pruebas de anticuerpos anti-dengue, el antígeno NS1 se detectó en 30,52% (65/213) y los anticuerpos IgM se encontraron en 9,39% (20/213) de los pacientes. DENV-2 fue el serotipo más predominante en 60,65% (37/61) de los casos; DENV-3 se encontró sólo en una muestra y 37,70% (23/61) no se pudo caracterizar para ningún serotipo; No se encontraron serotipos DENV-1 o DENV-4. Los síntomas más comunes asociados con la fiebre fueron: dolor de cabeza (96,72%), dolor muscular (86,89%), dolor en las articulaciones (83,61%), falta de apetito (73,77%) y dolor retro-orbital (72,13%). Conclusiones: El DENV-2 es actualmente el serotipo predominante en Piura, Perú. En pacientes con muestras positivas para PCR sólo el dolor lumbar (p = 0,008) es estadísticamente significativo. Se deben realizar más investigaciones para evaluar el uso de RT-PCR como un método confiable para la detección de DENV, así como para la vigilancia de serotipos en el Perú.

ABSTRACT Background: Dengue infections are a major health problem and there is an increasing necessity to strength its epidemiological surveillance in Peru due to the low laboratory-confirmation rate (<50%). Aim: To assess the frequency of Dengue virus (DENV) serotypes and describe its clinical and epidemiological presentation in patients from Piura, an endemic area in northern Peru. Methodology: A total of 213 serum samples from eight health care centers were studied for the presence of DENV via RT-PCR, NS1 antigen and IgM antibodies from March to August 2016. PCR positive samples were sent for commercial sequencing and serotype 1 to 4 identification. Physicians used a standardized questionnaire to collect the demographic and clinical symptoms information. Results: Dengue virus RNA was detected in 28.64% (61/213) of the samples via qPCR. For the anti-Dengue antibody tests, the NS1 antigen was detected in 30.52% (65/213) and IgM antibodies were found in 9.39% (20/213) of patients. DENV-2 was the most predominant serotype in 60.65% (37/61) of cases; DENV-3 was found only found in one sample and 37.70% (23/61) could not be characterized for any serotype; no DENV-1 or DENV-4 serotypes were found. The most common symptoms associated with fever were: Headache (96.72%), muscle pain (86.89%), joint pain (83.61%), low appetite (73.77%) and retro-orbital pain (72.13%). Conclusions: DENV-2 is currently a predominant serotype in Piura, Peru. In patients with PCR positive samples only low back pain (p=0.008) is statistically significant. Further investigations should be conducted to assess the use of RT-PCR as a reliable method for DENV detection as well as for serotype surveillance in Peru.