Identificación molecular de bacterias asociadas a cuadros clínicos de Tuberculosis - Arequipa

Abstract

La tuberculosis es una de las enfermedades con mayor causas de muertes en el mundo pero se desconoce la presencia y diversidad bacteriana, en la cual el estudio del microbioma en la tuberculosis pulmonar y extrapulmonar está muy poco investigado, es por eso que en el presente trabajo se analizaron muestras con cuadros clínicos de tuberculosis, y en las que se realizo la identificación molecular a las bacterias presentes en ellas. Para los análisis se realizó la evaluación mediante PCR con primer específicos, correspondiente al elemento repetitivo del sitio de inserción IS6110 para M. Tuberculosis, la cual se identificó por la presencia o ausencia de la banda de 123 pb, visualizado en un gel de agarosa al 2% teñido con SYBER safe, en transiluminador de luz azul de Invitrogen. En el presente estudio, para identificar las bacterias presentes en las muestras se realizó la secuenciación de alto rendimiento ( secuenciamiento metagenómico) del gen 16S RNAr y un análisis bioinformático, en el cual se tomó las muestras diagnosticadas de muestras de biopsia de mama con diagnostico positivo y negativo para tuberculosis y muestras de esputo con diagnostico positivo y negativo para tuberculosis, estas fueron seleccionadas por ser muestras con mayor audiencia en el laboratorio, de estas muestras se obtuvo la diversidad bacteriana y la abundancia relativa. Se identificó a los Filum en las muestras de biopsia de mama con diagnostico de tuberculosis positivo, siendo los más abundantes Firmicutes y Proteobacteria y dentro de ellos a los géneros Psychrobacillus seguido de Pseudomonas y en las muestras con diagnostico negativo para tuberculosis de encontró a los Filum Proteobacteria, Firmicutes y bacteroides con el género Pseudomonas. Y en las muestras de esputo positivo para tuberculosis a los Filum Firmicutes, Bacteroides y Proteobacteria con los géneros Prevotela, Streptococcus, Veillonella y Pseudomonas y en las muestras de esputo negativo para tuberculosis a los Filum Actinobacteria, Proteobacteria, Bacteroides y Firmicutes con los géneros con mayor abundancia a Rothia, Prevotella y Pseudomonas, Esto se relaciona con los estudios realizados por Bernal, Cui, Z., Cheung , Wu J, Krishna entre otros, en lo que se concluye que la enfermedad de tuberculosis, no solo es afectada por una bacteria (M. tuberculosis) si no que interactúa en muchos casos con otras, llegando incluso a ser estas las que compliquen la enfermedad, junto a las bacterias oportunistas. Por lo que se llegó a la conclusión de que en la enfermedad de la tuberculosis no es una afección ocasionada por una única bacteria, si no por el contrario, se presenta por la interacción de un grupo de bacterias a las cuales se les tendría que seguir estudiando para confirmar su acción sobre la enfermedad.