Caracterización molecular de seis poblaciones de Caoba (Swietenia macrophylla King) en el Perú

Abstract

Fue determinada la variabilidad genética poblacional de la caoba Swietenia macrophylla, a partir del análisis de 10 loci microsatélites en un total de 170 árboles de caoba provenientes de poblaciones naturales en las regiones Loreto, Ucayali y Madre de Dios. En términos globales, se observó una gran diversidad alélica tanto a nivel de especie (155 alelos, media 15.5 alelos por locus) como de localidades (riqueza alélica varió de = 11 a 24). El análisis factorial de correspondencia (AFC) muestra que las localidades no están claramente diferenciadas a nivel genético, observándose una fuerte sobreposición entre la mayoría de ellas; sin embargo, se puede observar que las poblaciones de la región Loreto (Yurimaguas y Pithecia) se encuentran ligeramente diferenciadas de las poblaciones de Ucayali (Breu y P. Esperanza) y de Madre de Dios (Iñapari y Otorongo). Los resultados del índice de Fijación (FST), distancia genética y flujo de genes muestran esta misma tendencia, observándose que las localidades de Yurimaguas y Pithecia fueron las que presentaron mayor diferenciación con las cuatro localidades restantes (valores variaron: FST de 0.044 a 0.82, Distancia genética de 0.12 a 0.25 y Flujo de genes de 2.78 a 5.37). El dendrograma y el resultado del análisis bayesiano de estructuración mostraron también que las localidades de Yurimaguas y Pithecia se encuentran conformando una agrupación genética distinta de la del cluster (Bootstrap = 100% y K = 2) de las demás poblaciones. La distancia geográfica entre estas dos agrupaciones responde grandemente a la diferencia genética entre ellas (r = 0.85), el resto de la diferencia podría estar relacionada a otros factores tales como la topografía, tipo de suelo, composición florística y una entomofauna específica para cada bioma.

The population genetic variability of the mahogany Swietenia macrophylla was determined, from the analysis of 10 microsatellite loci in a total of 170 mahogany trees from natural populations in the Loreto, Ucayali and Madre de Dios regions. In global terms, it is a great allelic diversity both at the species level (155 alleles, average 15.5 alleles per locus) and localities (allelic wealth varied from = 11 to 24). The factorial correspondence analysis (AFC) shows that the locations are not clearly differentiated at the genetic level, with a strong overlap between most of them; however, it can be seen that the populations of the Loreto region (Yurimaguas and Pithecia) are slightly differentiated from the populations of Ucayali (Breu and P. Esperanza) and Madre de Dios (Iñapari and Otorongo). The results of the Fixation Index (FST), genetic distance and gene flow identified this trend, observing the localities of Yurimaguas and Pithecia were those that presented the greatest differentiation with the four remaining locations (variable values: FST from 0.044 to 0.82, genetic distance from 0.12 to 0.25 and gene flow from 2.78 to 5.37). The dendrogram and the result of the Bayesian structuring analysis also identified as the locations of Yurimaguas and Pithecia are forming a different genetic cluster cluster (Bootstrap = 100% and K = 2) of the other populations. The geographical distance between these two groups responds greatly to the genetic difference between them (r = 0.85), the rest of the difference could be related to other factors such as topography, soil type, floristic composition and a specific entomofauna for each biome.